SCAR分子标记技术在香菇菌株鉴定上的应用研究
SCAR分子标记技术在香菇菌株鉴定上的应用研究 APPLICATION OF SCAR MOLECULAR MARKER TECHNOLOGY IN IDENTIFICATION OF LENTINULA EDODES 吴学谦 李海波 魏海龙 付立忠 吴庆其 彭华正 朱睦元 摘 要:为了建立一套基于DNA分子标记技术快速鉴定香菇菌株的有效方法,本研究首先通过对生产上常用的14个香菇菌株进行RAPD多态性分析,从香菇菌株162中扩增获得了一个片段长为1166bp的特异RAPD标记XG1166,随之利用分子克隆技术将该特异RAPD标记成功转化为稳定的SCAR标记.用同样的方法,本研究又从另一香菇菌株申香10号中获得了一段长度为347bp的特异SCAR标记SX347.试验结果表明,利用本研究获得的香菇菌株162和申香10号的特异SCAR标记,能在一天时间内准确鉴定出香菇菌株162或申香10号菌株的真伪.由此可见,SCAR分子标记是一种快速、稳定、准确鉴定香菇菌株的新方法,可应用于食用菌种质资源保护利用、品种分类与鉴定和假种辨别. 关键词:食用菌,种质资源,快速鉴定,分子克隆技术,RAPD标记 分类号:Q78 文献标识码:A 文章编号:1672-6472(2005)02-0259-0266 基金项目:浙江省重点攻关项目(2004C22032、2004C22057),浙江省自然科学基金项目(Y304403) 作者单位:吴学谦(浙江省林业科学研究院生物技术研究所,杭州,310023) 李海波(浙江省林业科学研究院生物技术研究所,杭州,310023) 魏海龙(浙江省林业科学研究院生物技术研究所,杭州,310023) 付立忠(浙江省林业科学研究院生物技术研究所,杭州,310023) 吴庆其(丽水市食用菌研究开发中心,丽水,323000) 彭华正(浙江省林业科学研究院生物技术研究所,杭州,310023) 朱睦元(浙江大学生命科学学院,杭州,310029) 参考文献: [1]Guo LH, Jing DM, Wang B, Liu M, Chao Y, Yong W, Chen YQ, Wen ML, 2002. Variety identification and genetic diversity analysis of rose with RAPD molecular markers. Acta Horticulturae Sinica, 29 (6): 551~555 (in Chinese ) [2]Huang ZF, Zhang WJ, Yu BL, Zhou WJ, Li M, Li AS, 2000. The chromosome-specific PCR marker's screening and identication of barley 6H chromosome. Acta Genetica Sinica, 27 (8): 713~718 (in Chinese ) [3]Lahgue F, This P, Bouquet A, 1998. Identification of a codominant scar marker linked to the seedlessness character in grapevine. Theoretical and Applied Genetics , 97(5~6): 950~959 [4]Li JD, Lin YX, 2002. Application of RAPD technique in edible fungi in China. Edible Fungi of China, 21 (6): 6~8 (in Chinese ) [5]Liu ZY, 2000. DNA fingerprinting technology and its use in fungal classification. Journal of Mountain Agriculture and Biology, 19 (5):460-469 (in Chinese ) [6]Liu ZY, Sun QX, Ni ZF, Yang ZM, Tang BR, Yang AD, Jia X, 1999. Development of SCAR markers linked to the Pm21 gene conferring resistance to the powdery mildew in common wheat. Plant Breeding, 118:215~219 [7]Hermosa MR, Grondona I, Minguez JMD, Iturriaga EA, Monte E, 2001. Development of a strain-specific SCAR marker for the detection of Trichoderma atroviride 11, a biological control agent against soilborne fungal plant pathogens. Current Genetics, 38(6): 343~350 [8]Paran I, Michelmore RW, 1993. Development of reliable PCR-based markers linked to downy mildew resistance genes in lettue. Theor Appl Genet, 85:985~993 [9]Ping WX, Li HY, 2002. Polymorphic marker technique of DNA molecular and its application. Sugar Crops of China, 4:27~33 (in Chinese ) [10]Xiang TH, Yang JB, Li L, Yang QJ, Zhu QS, Huang DN, 2003. Development of RAPD markers and SCAR markers linked to bentazon susceptible lethality gene in rice. Acta Botanica Sinica, 45 (2): 223~228 (in Chinese ) [11]Yang H, Li LT, 2002. Research on edible fungi DNA extractive methods. Edible Fungi of China, 22 (1): 19~22 (in Chinese ) [12]Zheng HS, Chen MJ, Tan Q, Shang XD, Pan YJ, 2002. Identification of seven Lentinula edodes strains based on partial sequence analysis of 25S rRNA gene. Acta Edulis Fungi, 9 ( 1): 10~12 (in Chinese ) [13]郭立海,金德敏,王斌,刘敏,巢阳,勇玮,陈毓荃,翁曼丽,2002月季种质鉴定和多样性分析.园艺学报,29(6):551~555 [14]黄朝峰,张文峻,余波澜,周文娟,李鸣,李安生,2000.大麦6H染色体特异性标记的筛选和鉴定.遗传学报,27(8):713~718 [15]李继东,林跃鑫,2002.RAPD技术在我国食用菌研究中的应用.中国食用菌,21(6):6~8 [16]刘作易,2000.DNA指纹技术的发展及其在真菌分类上的应用山地农业生物学报,19(5):460-469 [17]平文祥,李海英,2002.DNA分子多态性标记技术及应用.中国糖料,4:27~33 [18]向太和,杨剑波,李莉,杨前进,朱启升,黄大年,2003.水稻苯达松敏感致死基因的RAPD标记和SCAR标记植物学报,45(2):223~228 [19]杨华,李联泰,2002.食用菌DNA提取方法研究.中国食用菌,22(1):19~22 [20]郑海松,陈明杰,谭琦,尚晓冬,潘迎捷,2002.25S rRNA基因部分序列比较在香菇栽培菌种鉴定上的应用.食用菌学报,9(1):l0~12 菌物学报 MYCOSYSTEMA 2005 Vol.24 No.2 P.259-266
